ReFigure:将科学数据保存到仪表板中,并分享您的见解

客人的博客

重新塑造标志这篇文章是由ReFigure的联合创始人客座博主Girija Goyal贡献的。

阅读和探索,包括复制和实验,导致“负面数据”通常主导项目的早期。在此期间获得的知识的传播很少发生,也很少出现在完整出版物中发现的少量精选数据中。作为早期的职业研究人员,我们想知道如何让我们在这段时间里获得的见解更加明显,从而对科学产生积极的影响。

重新塑造节省时间和知识,让你的洞察力被发现。观看这个快速视频了解ReFigure是如何工作的,并继续阅读更多细节。

你花多少时间阅读科学文献?通常,感兴趣的数据是一篇论文中的一两个数字,然后是另一篇论文中的另一个数字。很多读者一遍又一遍地重复相同的内容,因为他们不会保留从阅读过程中收集到的见解。记住当药物X加入到Y细胞系,或者a的表型一种特定基因被敲除的老鼠在美国,通常你需要记住的是实验,而不是论文。为了避免阅读整篇论文,您可能会搜索谷歌图像以获得特定的实验结果,但显然,这不是最佳方法。

如果你可以将感兴趣的数据与文章元数据、图例和用户创建的注释一起保存在“为科学家的Pinterest”上,会怎么样呢?重新塑造扩展是一个简单的Chrome插件,允许您保存任何文章从PubMed中心公开可用的图像(也eLife, PLOS和Figshare)。一些用例包括:

  1. 象这样对试剂的性能进行分类抗体重新塑造
  2. 分析复制,如这个重新塑造是否Natronobacteriumgregoryi阿尔戈瑙特有任何DNA编辑功能
  3. 收集临床前和临床资料关于疾病或治疗的
  4. 并排比较不同细胞系/模型系统的相同实验

ReFigure允许您从大量开放获取的生命科学数据中进行有意义的收集。您可以使用ReFigure将分析结果与文献综述中的相关数据保存在一起。再也不用找遍整个文件夹的文件来找到正确的实验了!ReFigure扩展还告诉读者,如果他们正在阅读的论文已经在ReFigure中链接,让别人很容易发现你对一个主题的见解。

除了整理他人的数据外,您甚至可以在ReFigure中包含您自己的数据。例如,您可能会包含一个确认图像,以显示以前使用的试剂性能良好,或者您可能会发布作为项目设置的一部分进行的复制实验。这些数据是有价值的,但仍然隐藏在研究论文中,因为它们不包括在传统出版物。将你的资料提交至资料库(Figshare您可以将它包含在ReFigure中。

重塑形象对你和科学都有好处

ReFigures可以立即发布,作者可以在任何时候进行编辑。您的ReFigure中包含的见解可能对您所在领域的其他科学家有益,同时为您提供可视性。例如,早在一项涉及多名患者的研究发表之前,寨卡病毒研究人员克里斯塔·奥苏纳(Christa Osuna)就整理了寨卡病毒病例研究,做出了一项可以在ReFigure社区获得meta分析.ReFigure还使特定领域的专家更容易分享他们的专业知识发现是复制品ducible。例如,请参阅我们的ReFigures关于治疗性使用抗cd47抗体在免疫肿瘤中的作用。

美国国立卫生研究院(NIH)和维康基金会(Wellcome Trust)等资助机构现在在资助计划中接受中期研究产品(预注册、预印本、数据、软件、微型出版物)。ReFigures就是这样一种研究产品,它可以说服评论家相信你的专业知识和洞察力。我们建议你在Linkedin和ResearchGate上分享ReFigures。

要了解如何在几分钟内创建ReFigures,请访问我们的YouTube频道.目前,我们只能连接PubMed Central、eLife、PLOS和Figshare的数据,但我们正在努力扩大我们的覆盖范围。我们不能为您节省阅读论文和做实验的艰苦工作,但我们绝对可以给您信用,并增加您的影响!

下载ReFigure扩展并访问ReFigure.org。您可以通过以下方式联系ReFigure团队refigure@refigure.org

请通过创建ReFigures和回答这个问题来支持ReFigure2分钟的调查!你也可以在Twitter (@re_figure),脸谱网,LinkedIn


非常感谢我们的客座博主Girija Goyal!

Girija Goyal是一位早期的职业研究员,并与Joe Akin共同创立了ReFigure。她设想了一个世界,在那里,教学和科研的影响是迅速的、具体的,并对所有人的创新开放。

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