测量自噬通量的荧光生物传感器

由贝丝学会主席

自噬(希腊语,意为“自我吞噬”)是包括细胞器在内的细胞质物质被溶酶体降解的过程。自噬是一个动态过程,涉及自噬体合成、将要降解的物质输送到溶酶体以及溶酶体内自噬底物的降解。历史上,研究自噬的方法主要是计算自噬体的数量。然而,这种方法有固有的局限性,因为它将动态过程转变为静态测量,并提供了关于自噬的靶向物质或细胞器的有限信息。几种荧光自噬报告的发展现在允许测量自噬通量,或自噬活性的变化,是一个更可靠的自噬活性指标。这篇文章的目的是概述目前从Addgene获得的四种自噬生物传感器。自噬途径

Rosella自噬生物传感器

罗塞拉是一种双发射自噬生物传感器,由两种串联荧光蛋白组成:一种相对pH不敏感的RFP变体DsRed.T3,它与一种pH敏感的GFP变体超级黄道荧光金宝搏app下载蛋白(SEP)相连。在没有自噬的情况下,未靶向的蔷薇属植物保留在中性pH细胞质中,并在那里发出红色和绿色荧光。在大量自噬诱导后,蔷薇属植物以酵母中的液泡或哺乳动物细胞中的溶酶体为靶向。pH值的降低会使SEP猝灭,但不会使DsRed猝灭,从而导致仅发射红色荧光。红色与绿色荧光的比率允许清楚区分液泡/溶酶体和细胞质Rosella。当与线粒体靶向序列融合时,Rosella可用于跟踪线粒体的靶向自噬或有丝分裂吞噬。Rosella还可以与一种感兴趣的蛋白质融合,以跟踪该蛋白质的自噬.

Rosella自噬生物传感器

找到细胞溶胶靶向线粒体靶向罗塞拉Addgene !

Keima自噬生物传感器

凯玛是一种哺乳动物双发射自噬生物传感器。它对溶酶体蛋白酶的抗性是其ph依赖性荧光的关键。在中性环境中,二聚体Keima在440 nm处被激发,在酸性环境中在586 nm处被激发。不管激发波长如何,Keima的发射波长为620 nm。在586 nm和440 nm处激发的信号强度的比值是衡量自噬诱导的指标:当Keima在细胞质中时,这个比值较低;但当凯玛在自溶酶体中积累时,该比值较高。当未靶向时,Keima可用于测量体自噬,但添加线粒体靶向序列使Keima可用于监测自噬。重要的是要记住,因为Keima的荧光依赖于溶酶体的酸度,这种生物传感器不能用于固定的细胞。

Keima自噬生物传感器

在Addgene找到线粒体靶向的Keima变体!

mRFP-GFP-LC3串联荧光蛋白

这种自噬生物传感器包含与自噬相关微管相关蛋白1A/1B轻链3B或LC3融合的mRFP和GFP。LC3是测量自噬流量的常用标记物。mRFP-GFP-LC3通过与Rosella相同的机制发挥自噬生物传感器的作用:GFP在酸性环境中猝灭,而mRFP相对稳定,即使在溶酶体中发现的酸性pH值下也能发出荧光。因此,自噬体的形成导致黄色斑点(GFF阳性/RFP阳性)增加,自噬体与溶酶体融合后这些斑点变红(GFP阴性/RFP阳性)。自噬的增加导致更多的黄点和红点,而自噬体与溶酶体融合的阻滞导致黄点增加,而红点减少。

mRFP-GFP-LC3串联探针

在Addgene找到mRFP-GFP-LC3质粒!

GFP-LC3-RFP-LC3∆G:释放内部控制的荧光探针

GFP-LC3-RFP-LC3deltaG串联探针的ATG4裂解

另一种自噬生物传感器是GFP-LC3-RFP-LC3ΔG探针。它类似于mRFP-GFP-LC3串联荧光蛋白,但翻译后,这个融合蛋白被切割,生成一个gfp标记的LC3分子对应一个rfp标记的LC3∆G。

与未修饰的LC3一样,GFP-LC3与磷脂酰乙醇胺(PE)并被招募到自噬体膜,从而导致其通过自噬降解。RFP-LC3∆G、 然而,由于C-末端甘氨酸缺失,不能与PE结合,因此它保留在细胞质中作为内部控制。A.自噬流量通过以下公式估算:GFP / RFP比率:相对于RFP荧光,GFP荧光减少表明自噬通量增加,而GFP荧光相对于RFP荧光的增加表明自噬通量减少。

在Addgene找到GFP-LC3-RFP-LC3∆G质粒!

GFP-LC3-RFP-LC3ΔG串联探头

参考文献

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